Organizacija rada funkcionira kroz pet Službi i to:
Služba za resocijalizaciju izvršava odgojnu mjeru upućivanja maloljetnika u Odgojni centar, prema odluci Općinskog suda Sarajevo. Na izvršenje ove odgojne mjere maloljetnici mogu biti upućeni na određeni broj sati tokom dana u trajanju najmanje 14 dana, a najduže 30 dana i na neprekidni boravak u trajanju od najmanje 15 dana, ali ne duže od tri mjeseca.
Služba izvršava i mjeru privremenog smještaja prema maloljetnicima za vrijeme trajanja pripremnog postupka (mjera umjesto pritvora), a prema odluci Općinskog suda Sarajevo. Smještaj maloljetnika u toku pripremnog postupka se provodi s ciljem izdvajanja iz sredine u kojoj su živjeli, smještaja ili zaštite, te pružanja stručne pomoći i podrške.
Također, Služba provodi izvršenje prekršajne odgojne mjere, posjećivanja odgojnog, obrazovnog, psihološkog i druge vrste savjetovališta a prema rješenju Općinskog suda Sarajevo-Odjeljenje za prekršaje, ili zahtjevu nadležne Službe socijalne zaštite. Navedene odgojne mjere mogu trajati najduže jednu godinu.
Služba za resocijalizaciju stručni rad realizuje prateći savremena dostignuća u oblasti psiho-socijalnog, sociološkog, penološkog i pedagoškog rada.
Služba za dijagnostiku i opservaciju vrši prihvat i smještaj maloljetnika radi identifikacije, utvrđivanja, i procjene etiologije stepena i intenziteta prisutnih poremećaja u ponašanju maloljetnika uzrasta (od četrnaest do osamnaest godina, oba spola), koji su upućeni na dijagnostičku obradu od strane nadležnog suda ili tužilaštva, s ciljem predlaganja odgovarajućih odgojnih mjera, zaštite i tretmana maloljetnika.
Opservaciono-dijagnostički postupak se može realizovati i na osnovu prijedloga stručnog tima i Odluke direktora, za maloljetnike koji su već obuhvaćeni pružanjem nekom od usluga od strane Ustanove. O dijagnostičko opservacionom postupku se sačinjava stručno mišljenje ili nalaz koji se dostavlja uputnom organu.
Služba za zbrinjavanje djece u stanju potrebe realizuje cjelodnevni i poludnevni boravak, te doprinosi obezbjeđivanju brige i zaštite djeci i maloljetnicima koji se nalaze u stanju socijalne potrebe, i djeci koja su izložena rizicima koji onemogućavaju njihov noramalan rast i razvoj uzrasta do 18 godina. Djeca starosne dobi do 6 godina borave u pratnji roditelja, dok se na cjelodnevni boravak zbrinjavaju djeca/maloljetnici dobne uzrasti od 8 do 18 godina.
Kantonalni Centar za socijalni rad kao organ starateljstva, radi zaštite najboljeg interesa djeteta, rješenjem može odlučiti o smještaju djeteta/maloljetnika u Službu za zbrinjavanje djece u stanju potrebe i bez pristanka roditelja, a koji može trajati najduže dva mjeseca.
Služba za zbrinjavanje djece u stanju potrebe realizuje stručna predavanja i radionice koje imaju za cilj preventivno djelovanje na uzroke negativnih pojava koje utiču na normalan rast i razvoj djece.
Služba za preventivni rad realizuje stručni rad sa djecom i maloljetnicima uzrasta od 12 do 18 godina koji ispoljavaju društveno neprihvatljivo ponašanje, i gdje je prema procjeni Stručnog tima uz primjenu soci-pedagoških i psiholoških metoda rada moguće uticati na promjenu ponašanja maloljetnika.
Preventivne aktivnosti su usmjerene na razvijanje vještina i kompetencija djece/maloljetnike kroz pozitivne modele ponašanja, koji će im omogućiti lakše suočavanje i odupiranje socijalnim pritiscima kojima su izloženi tokom odrastanja. Također, planirane aktivnosti preventivnog djelovanja se realizuju u pravcu osnaživanja i zadovoljavanja osnovnih psiholoških potreba djeteta/maloljetnika, te učenju vještina nenasilnog rješavanja konflikata i samokontroli.
Služba svoje aktivnosti realizuje kroz primarnu i sekundarnu prevenciju.
Primarna prevencija realizuje se u okviru implementacije projekata i programskih preventivnih aktivnosti u skladu sa zahtjevima osnovnih i srednjih škola KS, a koje podrazumijevaju bateriju radionica ili stručnih predavanja koja su usmjerena ka jedinstvenom cilju i zatvaraju jednu logičku cjelinu, i realizuju se s ciljem smanjenja društveno neprihvatljivog ponašanja maloljetnika
Sekundarna prevencija obuhvata individualne preventivne tretmane sa djecom i maloljetnicima koji se provode na osnovu zahtjeva roditelja/staratelja/hranitelja, Službe socijalne zaštite ili škole koju dijete/maloljetnik pohađa, a kod kojih se ukazuje potreba za stručnim radom. Kroz zajedničke aktivnosti i saradnju ustanova socijalne zaštite, a na osnovu iskazanih potreba za stručnim radom, sačinjavaju se individualni programi koji podrazumijevaju pružanje adekvatne stručne pomoći i podrške djeci/maloljetnicima i njihovim porodicama.